Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GMDSO60547 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GMDSO60547 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GMDSO60547 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GMDSO60547 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GMDSO60547 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GMDSO60547 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GMDSO60547 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GMDSO60547 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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