Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QRK9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QRK9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QRK9 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QRK9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms