Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms