Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms