Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HIF3AQ9Y2N7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HIF3AQ9Y2N7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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