Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms