Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms