Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms