Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms