Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms