Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZCCHC2Q9C0B9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms