Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms