Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms