Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIRIP3Q9BW71 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms