Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERPUD2Q9BSE4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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