Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SORT1Q99523 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms