Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms