Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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