Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRT1Q96EB6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms