Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TMCO5AQ8N6Q1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMCO5AQ8N6Q1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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TMCO5AQ8N6Q1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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TMCO5AQ8N6Q1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TMCO5AQ8N6Q1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCO5AQ8N6Q1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMCO5AQ8N6Q1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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