Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APTXQ7Z2E3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms