Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRCQ7RTU9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms