Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms