Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEXMIFQ5QGS0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEXMIFQ5QGS0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms