Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF628Q5EBL2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms