Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EIPR1Q53HC9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms