Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TWISTNBQ3B726 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms