Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FSCN1Q16658 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms