Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXNQ16595 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FXNQ16595 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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