Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms