Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCOA1Q15788 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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