Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMCO1Q147U7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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