Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF5Q13568 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms