Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CHAF1BQ13112 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CHAF1BQ13112 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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CHAF1BQ13112 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CHAF1BQ13112 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CHAF1BQ13112 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHAF1BQ13112 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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