Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TROQ12816 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TROQ12816 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TROQ12816 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TROQ12816 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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