Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RASGEF1BQ0VAM2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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