Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLFN5Q08AF3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLFN5Q08AF3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms