Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CALD1Q05682 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CALD1Q05682 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALD1Q05682 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CALD1Q05682 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms