Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms