Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC6A3Q01959 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms