Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E2F1Q01094 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms