Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVFC1P60507 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms