Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP12AP54707 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms