Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASP4P49662 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASP4P49662 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms