Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRP9P49458 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP9P49458 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP9P49458 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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