Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NSG1P42857 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms