Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms