Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP5C1P36542 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms