Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms