Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL9P32969 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL9P32969 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL9P32969 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms